在与抗生素耐药性的斗争中 ，应更加重视疾病预防 ，包括加强卫生和控制措施 。换句话说—让生物安全成为这场斗争的关键因素 。

关于在供人类食用的动物（食用动物）中使用抗生素 ，在兽医学中存在相当大的争议 。在食用动物中不当使用抗生素对人类健康造成的潜在威胁是巨大的 ，因为在这些畜禽中繁殖的抗药性细菌可能进入食品供应链 ，并可能在食品中广泛传播 。

抗生素常以治疗 、预防和亚治疗剂量用于食用动物生产 。每种抗生素使用范围各不相同 ，这些抗生素可同时应用于不同的猪群 、鸡群 。例如 ，美国每年有16%的泌乳奶牛接受乳房炎的抗生素临床治疗 ，但几乎所有奶牛在每次泌乳后都会接受预防剂量的抗生素乳房内灌注 ，以预防和控制未来的乳腺炎—主要产品是青霉素 、头孢菌素或其他β-内酰胺类药物 。同样 ，进入饲养场的肉犊牛有15%接受抗生素治疗 ，以治疗呼吸道疾病 ，但对表面健康的犊牛也给予治疗量抗生素 ，以防止预期的呼吸道疾病爆发 。在饲养场 ，大约42%的犊牛被饲喂泰乐菌素（一种兽用大环内酯类药物） ，以防止肝脏脓肿对生长产生负面影响 。在美国 ，约88%的生长猪饲料中添加抗生素 ，以预防疾病和促生长 ，这通常是四环素类或泰乐菌素 。